최고의파일럿에도전하는불타는젊음!마침내돌아온전설을만나라!해군최신전투기F-14기를모는젊은조종사매버릭대위(톰크루즈)는최고의실력을자부하는파일럿으로최정예전투기조종사를양성하는‘탑건’훈련학교에입학하게된다.그리고그곳에서생도들의교육을담당하는항공물리학전문가찰리(켈리맥길리스)와사랑에빠진다.그러나비행훈련도중매버릭이몰던전투기가제트기류에빠지면서엔진고장을일으키고,이때함께탈출을시도하던파트너구즈가목숨을잃게된다.의문의사고로돌아가신전투기조종사였던아버지에대한상처를이해한유일한친구구즈의죽음에충격에빠진매버릭은파일럿의꿈도연인과의사랑도모두포기하려하는데...